X.509 Sertifikasının bütünlüğünün korunması için sertifika içinde yer alan tüm bilgiler sertifikayı veren makam tarafından elektronik olarak imzalanır ve oluşan elektronik imza bu sertifikanın arkasına eklenir. Böylece sertifika alanlarından herhangi birisi üzerinde sonradan değişiklik yapılıp yapılmadığı kontrol edilebilir. Bir elektronik sertifikanın üstündeki elektronik imza doğrulanarak sertifikanın geçerliliği kontrol edilir.